西南科技大学设有十九个学院含有土木工程与建筑学院；环境与资源学院；制造科学与工程学院；应用技术学院（西山校区）；法学院；政治学院；外国语学院；体育学科部；成人教育学院；网络教育学院；城市学院（独立学院）：材料科学与工程学院；生命科学与工程学院；理学院；经济管理学院；文学与艺术学院；国防科技学院；信息工程学院；计算机科学与技术学院等学院。
西南科技大学核心专业设置有：机械设计制造及其自动化、材料科学与工程、功能材料、自动化、物流管理、法学、政治学与行政学、生物技术、地质工程、采矿工程、电子信息工程、计算机科学与技术、生物医学工程、软件工程、建筑学、土木工程、交通工程、工程力学、环境工程、测绘工程、安全工程、制药工程、食品科学与工程、生物工程、材料成型及控制工程、电气工程及其自动化、农学、园艺、动物科学、国际经济与贸易、经济学、工商管理、信息管理与信息系统、工业工程、工程管理、市场营销、会计学、电子商务、公共事业管理、财务管理、人力资源管理、旅游管理、工业设计、过程装备与控制工程、通信工程、城市规划、建筑环境与设备工程、材料物理、信息与计算科学、数学与应用数学、应用化学、地理信息系统、光信息科学与技术、信息安全、地理科学、应用心理学、应用物理学、广播电视新闻学、英语、汉语言文学、日语、对外汉语、新闻学、广告学、西班牙语、矿物加工工程、特种能源工程与烟火技术、商务英语、核化工与核燃料工程、物联网工程、思想政治教育、历史学、辐射防护与环境工程、信息对抗技术、核工程与核技术等几十个本科专业。
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