1995年，新疆现代职业技术学院的毕业证由吾甫尔尤努斯和少数有识之士，利用国家0755到79000的时势，出资10万元创办。刚开始主要提供高考辅导，成人高考辅导，短期培训班。1997年批准成立“新疆医学院”，后与新疆医学院合作创办“新疆医学院高等职业学院”。2004年3月4日，经自治区人民政府批准，报教育部备案，正式成立为民办普通高等职业技术学院——新疆现代职业技术学院，具有独立颁发国家文凭资格。成为新疆第一所民办高职院校，开启了新疆民办院校创办的历史先河。
2006年，在乌鲁木齐市政府2006年6号文件，即荒山绿化文件政策的支持下，现代学院在头屯河区马岐山荒山绿化中获得了3341多亩教育建设用地。荒山绿化完成70%(即2340亩)后，30%(即1100亩)可用于学校建设。2006年，新校区一期工程开工。在克服了几次建设资金短缺的困难后，一区党委、政府两次担保贷款(每次700万、600万)。最后，2008年7月，一期教学楼、四栋宿舍楼和食堂顺利完工。成为自治区第一所自建校区的民办高校。目前，我院建筑面积9.5万平方米，总投资近2亿元，固定资产总值近8亿元。藏书65万余册(其中电子书40万册)。自1995年建院以来，学院已为社会培养了26000名不同层次的医疗卫生专业人才。就业率保持在93%以上，护理与助产就业率在95%以上。毕业生遍布新疆各地州市县医院和乡镇卫生院，有的成长为社会精英或单位领导。
新疆现代职业技术学院文凭现设有护理学院、语言学系、基础医学教研室、公共体育教研室、实验室管理中心、职业技能培训中心、计算机中心等教学部门。以及教务处、学生处、人力资源部、财务部、后勤管理处、保卫处等教学和后勤服务部门。
新疆现代职业技术学院毕业证有护理、康复技术、助产、药学、医学检验技术、医学影像技术等六个专业。涵盖了普通高职院校全国统招、五年制统招、中专统招、成人高校统招等多个办学层次。现有学生6000人，教职工283人，其中专任教师127人，副高级以上职称56人，占35.2%，讲师30人，研究生21人，助教26人，见习助教26人。专任教师比例逐年上升，目前已达40.9%。
新疆现代职业技术学院毕业证累计教学实验仪器设备总值近3000万元，拥有人体形态学实验室、人体机能实验室、基础护理实验室、临床护理实验室、康复技能实验室等25个实验室。医院有60多个多媒体教室、控制室、语音室、计算室等教学设施。与自治区156家县级以上医院建立了长期稳定的合作关系。
为了保证教育教学质量，培养合格人才，坚持社会主义办学方向，学院有健全的行政和教学管理机构，党委、团委、工会等组织机构健全
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