北京大学设有六十个学院含有环境科学与工程学院；工学院；中国语言文学系；历史学系；考古文博学院；哲学系（宗教学系）；外国语学院；艺术学院；信息科学技术学院；计算机科学技术研究所；软件与微电子学院；对外汉语教育学院；国际关系学院；经济学院；光华管理学院；法学院；信息管理系；社会学系；政府管理学院；马克思主义学院；教育学院；新闻与传播学院；人口研究所；国家发展研究院；基础医学院；药学院；公共卫生学院；护理学院；公共教学部；医学人文研究院；医学网络教育学院；北京国际数学研究中心；深圳研究生院；信息工程学院；国际法学院；人文社会科学学院；深圳研究生院化学生物学与生物技术学院；汇丰商学院；环境与能源学院；信息工程学院；城市规划与设计学院；第一医院；人民医院；第三医院；口腔医院；第六医院、北京肿瘤医院；首钢医院；元培学院；先进技术研究院；中国社会科学调查中心；分子医学研究所；城市规划与设计学院；前沿交叉学科研究院 ；科维理天文与天体物理研究所 ；核科学与技术研究院等学院。
北京大学核心专业设置有：法语、日语、波斯语、临床医学、核物理、艺术学、口腔医学、计算机科学与技术、智能科学与技术、城市规划、空间信息与数字技术、财政学、金融学、新闻传播学、广播电视新闻学、广告学、编辑出版学、传播学、广播电视编导、英语、金融数学系、经济学、信息管理与信息系统、公共管理、市场营销、会计学、人力资源管理、公共政策学、城市管理、图书馆学、信息资源管理、工商管理、法学类 法学、外交学与外事管理、国际政治经济学、国际政治、政治学与行政学、统计学、物理学、地质学基地班、地球与空间科学、生物科学、环境科学、地球信息科学与技术、思想政治教育、社会学、社会学、哲学、宗教学、哲学、文科实验班、文科试验班、理科试验班、物理学、化学、天文学、数学、地质学、地球化学、地理科学、地理信息系统、科学与工程计算系、大气科学、理论与应用力学、电子信息科学与技术、微电子学、信息科学技术、材料化学、环境科学、生态学、心理学、化学、数学、地质学、力学、电子信息科学、数学与应用数学、理科试验班、理科实验班、工科试验班、护理学、预防医学、阿拉伯语、中国语言文学、德语、汉语言文学、古典文献、中国文学、应用语言学、俄语、菲律宾语、越南语、文科试验班、工程结构分析、工程力学、地矿、环境科学与工程、经济学、国际经济与贸易、西班牙语、中国语言文学、新闻学、希伯莱语、朝鲜语、印度尼西亚语、乌尔都语、印地语、泰语、文科实验班、缅甸语、历史学、考古、医学实验学、药学、应用药学、基础医学等几十个本科专业。
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